Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Pcf11G3X9Z4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Pcf11G3X9Z4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Pcf11G3X9Z4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Pcf11G3X9Z4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Pcf11G3X9Z4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Pcf11G3X9Z4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Pcf11G3X9Z4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Pcf11G3X9Z4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Pcf11G3X9Z4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Pcf11G3X9Z4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Pcf11G3X9Z4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Pcf11G3X9Z4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Pcf11G3X9Z4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Pcf11G3X9Z4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Pcf11G3X9Z4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Pcf11G3X9Z4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Pcf11G3X9Z4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pcf11G3X9Z4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Pcf11G3X9Z4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Pcf11G3X9Z4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Pcf11G3X9Z4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Pcf11G3X9Z4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Pcf11G3X9Z4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Pcf11G3X9Z4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Pcf11G3X9Z4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Pcf11G3X9Z4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Pcf11G3X9Z4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Pcf11G3X9Z4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Pcf11G3X9Z4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Pcf11G3X9Z4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Pcf11G3X9Z4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Pcf11G3X9Z4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Pcf11G3X9Z4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Pcf11G3X9Z4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Pcf11G3X9Z4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Pcf11G3X9Z4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Pcf11G3X9Z4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Pcf11G3X9Z4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Pcf11G3X9Z4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Pcf11G3X9Z4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Pcf11G3X9Z4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Pcf11G3X9Z4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pcf11G3X9Z4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pcf11G3X9Z4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Pcf11G3X9Z4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Pcf11G3X9Z4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Pcf11G3X9Z4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pcf11G3X9Z4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pcf11G3X9Z4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pcf11G3X9Z4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Pcf11G3X9Z4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Pcf11G3X9Z4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Pcf11G3X9Z4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Pcf11G3X9Z4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Pcf11G3X9Z4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Pcf11G3X9Z4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Pcf11G3X9Z4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Pcf11G3X9Z4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms