Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ88

Gm5145, Predicted pseudogene 5145, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5145F8VQ88 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5145F8VQ88 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5145F8VQ88 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5145F8VQ88 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5145F8VQ88 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5145F8VQ88 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5145F8VQ88 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5145F8VQ88 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5145F8VQ88 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5145F8VQ88 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5145F8VQ88 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5145F8VQ88 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5145F8VQ88 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5145F8VQ88 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.9 ms