Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ythdc1E9Q5K9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc1E9Q5K9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ythdc1E9Q5K9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ythdc1E9Q5K9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ythdc1E9Q5K9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ythdc1E9Q5K9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ythdc1E9Q5K9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ythdc1E9Q5K9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ythdc1E9Q5K9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ythdc1E9Q5K9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ythdc1E9Q5K9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms