Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C2cd2E9Q3C1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2cd2E9Q3C1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd2E9Q3C1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2cd2E9Q3C1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2cd2E9Q3C1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms