Protein–RNA interactions for Protein: E9Q286

Ice1, Little elongation complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ice1E9Q286 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ice1E9Q286 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ice1E9Q286 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ice1E9Q286 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ice1E9Q286 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ice1E9Q286 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ice1E9Q286 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ice1E9Q286 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ice1E9Q286 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ice1E9Q286 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ice1E9Q286 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ice1E9Q286 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ice1E9Q286 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms