Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r49D3Z6L3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r49D3Z6L3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r49D3Z6L3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r49D3Z6L3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r49D3Z6L3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r49D3Z6L3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms