Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
3425401B19RikD3Z1D3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
3425401B19RikD3Z1D3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
3425401B19RikD3Z1D3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
3425401B19RikD3Z1D3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
3425401B19RikD3Z1D3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
3425401B19RikD3Z1D3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
3425401B19RikD3Z1D3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
3425401B19RikD3Z1D3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
3425401B19RikD3Z1D3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
3425401B19RikD3Z1D3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
3425401B19RikD3Z1D3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
3425401B19RikD3Z1D3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
3425401B19RikD3Z1D3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
3425401B19RikD3Z1D3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
3425401B19RikD3Z1D3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
3425401B19RikD3Z1D3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
3425401B19RikD3Z1D3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
3425401B19RikD3Z1D3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
3425401B19RikD3Z1D3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
3425401B19RikD3Z1D3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
3425401B19RikD3Z1D3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms