Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grik3B1AS29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grik3B1AS29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grik3B1AS29 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grik3B1AS29 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grik3B1AS29 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grik3B1AS29 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik3B1AS29 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Grik3B1AS29 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grik3B1AS29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Grik3B1AS29 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Grik3B1AS29 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Grik3B1AS29 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Grik3B1AS29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Grik3B1AS29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Grik3B1AS29 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Grik3B1AS29 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Grik3B1AS29 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Grik3B1AS29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms