Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3173A6NAS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3173A6NAS3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm3173A6NAS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3173A6NAS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3173A6NAS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm3173A6NAS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3173A6NAS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms