Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Klhl41A2AUC9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl41A2AUC9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhl41A2AUC9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl41A2AUC9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Klhl41A2AUC9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl41A2AUC9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms