Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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