Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AgrnA2ASQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AgrnA2ASQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AgrnA2ASQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AgrnA2ASQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AgrnA2ASQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AgrnA2ASQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AgrnA2ASQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AgrnA2ASQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms