Protein–RNA interactions for Protein: A2AEP0

Obp1b, Odorant-binding protein 1b, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obp1bA2AEP0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Obp1bA2AEP0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Obp1bA2AEP0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Obp1bA2AEP0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obp1bA2AEP0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Obp1bA2AEP0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Obp1bA2AEP0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Obp1bA2AEP0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Obp1bA2AEP0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Obp1bA2AEP0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Obp1bA2AEP0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Obp1bA2AEP0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms