Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H5

Trbv20, T cell receptor beta, variable 20 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv20A0A0B4J1H5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trbv20A0A0B4J1H5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv20A0A0B4J1H5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv20A0A0B4J1H5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trbv20A0A0B4J1H5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbv20A0A0B4J1H5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms