Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA3Q9Y6Q9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA3Q9Y6Q9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA3Q9Y6Q9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA3Q9Y6Q9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA3Q9Y6Q9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA3Q9Y6Q9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA3Q9Y6Q9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCOA3Q9Y6Q9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCOA3Q9Y6Q9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms