Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms