Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms