Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KNSTRNQ9Y448 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms