Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPR55Q9Y2T6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPR55Q9Y2T6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms