Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI3Q9ULW8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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