Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms