Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN1Q9ULB1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms