Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM10Q9UDY6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM10Q9UDY6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms