Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIP2Q9UDT6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms