Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABBR1Q9UBS5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABBR1Q9UBS5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms