Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLAIN2Q9P270 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLAIN2Q9P270 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms