Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN3Q9P232 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms