Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP1Q9NZU7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms