Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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