Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BARHL2Q9NY43 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms