Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PGPEP1Q9NXJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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