Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDHAF2Q9NX18 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms