Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCIQ9NVI1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FANCIQ9NVI1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms