Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTLC3Q9NUV7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms