Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms