Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKDREJQ9NTG1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms