Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms