Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms