Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TOPORSQ9NS56 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms