Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAPOLBQ9NRJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms