Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM10Q9NQV6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms