Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCNB1IP1Q9NPC3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms