Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPCPD1Q9NPB8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPCPD1Q9NPB8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPCPD1Q9NPB8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms