Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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