Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELP3Q9H9T3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELP3Q9H9T3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms