Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms