Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP3Q9H6T3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms