Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms