Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD1Q9GZZ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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