Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCSER1Q9C0I3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER1Q9C0I3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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