Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRCC1Q9C099 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms